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Tipo do documento: Tese
Título: Caracterização molecular de linhagens de escherichia coli resistentes aos ß-lactâmicos isoladas de pacientes com infecção do trato urinário
Autor: Porto, Naiady Konno Madela 
Primeiro orientador: Nogueira, Mara Corrêa Lelles
Primeiro coorientador: Casella, Tiago
Primeiro membro da banca: Mazaro, Carolina Colombelli Pacca
Segundo membro da banca: Versiani, Alice Freitas
Resumo: As infecções do trato urinário (ITU) devido à Escherichia coli uropatogênica resistente a beta-lactâmicos são um importante problema de saúde pública. A falha do tratamento pode resultar na progressão para condições graves com insuficiência renal, sepse e morte. Objetivos. No presente trabalho, propomos realizar a avaliação de E. coli resistentes a cefalosporinas de terceira geração isoladas de pacientes com ITU. Além de investigar e comparar perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos, os genes responsáveis pela produção de ESBL e a diversidade de genes de virulência. Estas bactérias foram também comparadas quanto ao grupo filogenético e similaridade genética usando-se a tipagem molecular por análise do perfil de macrorrestição do DNA cromossômico após eletroforese em campo pulsado (PFGE) e sequenciamento de multilocus (MLST). Material e Métodos. Neste estudo, cepas de E. coli resistentes a cefalosporinas de terceira geração isoladas de pacientes com ITU foram investigadas e comparadas quanto à diversidade de genes responsáveis pela produção de betalactamase de espectro estendido (ESBL), genes de virulência e grupo filogenético. Além disso, foram submetidos à tipagem molecular por eletroforese em campo pulsado (PFGE) e seqüenciamento multilocus (MLST). Resultados. Variantes do gene blaCTX-M foram detectadas em todas as 61 E. coli produtoras de ESBL. O gene blaCTX-M-15 foi identificado em 37 isolados, blaCTX-M-8 e blaCTX-M-9 em sete cada um, blaCTX-M-14 em cinco, blaCTX-M-2 em três, e os genes blaCTX-M-3 e blaCTX-M-55, cada um em um isolado. 29 E. coli foram identificados do grupo B2, 17 do grupo A, 10 do grupo D e cinco do grupo B1. Dentre os 26 genes de virulência investigados, 17 foram detectados em diferentes combinações e distribuídos em E. coli de todos os filogrupos. Uma ampla diversidade genética foi observada, e a porcentagem de similaridade entre as linhagens variou entre 51,1,1% e 100%. A tipagem por MLST foi realizada nas 58 dos isolados incluídos neste estudo. Destes, 27 (46,5%) foram identificados como ST/CC 131/131, nove (15,5%) como ST/CC 90/23, seis (10,3%) como ST/CC 405/405, duas (3,4%) como ST/CC 10/10, ST224, ST/CC 617/10 ou ST 2851, e os demais isolados foram identificados como ST/CC 57/350, ST/CC 155/155, ST/CC 354/354, ST/CC 648/648, ST 1177, ST 1284, ST 2208 ou ST 8022, com um (1,7%) representante cada linhagem. Conclusões. Os resultados do presente estudo permitem concluir que a presença de E. coli produtoras de ESBL e resistentes a fluoroquinolonas está, principalmente, relacionada à microbiota de cada paciente. Também, as linhagens encontradas em São José do Rio Preto são as mesmas distribuídas em todo o mundo carreadoras dos mesmos genes blaCTX-M e potenciais causadoras de ITU ou distribuídas em alimentos ou como comensais de animais, demonstrando sua ampla disseminação e facilidade de aquisição.
Abstract: Urinary tract infections (UTIs) due to beta-lactam-resistant uropathogenic Escherichia coli are an important public health problem, as those are the main recommended antimicrobials. Treatment failure may result in progression to severe conditions with renal failure, sepsis and death. Objective. In the present work, we propose to evaluate third generation cephalosporin resistant E. coli isolated from UTI patients. In addition to investigating and comparing antimicrobial susceptibility profile, the genes responsible for ESBL production and virulence gene diversity. These bacteria were also compared for phylogenetic group and genetic similarity using molecular typing by analysis of chromosomal DNA macrorresting profile after pulsed field electrophoresis (PFGE) and multilocus sequencing (MLST). Material and methods. In this study, strains of E. coli resistant to third generation cephalosporins isolated from patients with UTI were investigated and compared for the diversity of genes responsible for the production of extended spectrum beta-lactamase (ESBL), virulence genes and phylogenetic group. In addition, they were submitted to molecular typing by pulsed field electrophoresis (PFGE) and multilocus sequencing (MLST). Results. Variants of the blaCTX-M gene were detected in all ESBL producing E. coli. The blaCTX-M-15 gene was identified in 37 isolates, blaCTX-M-8 and blaCTX-M-9 in seven each, blaCTX-M-14 in five, blaCTX-M-2 in three, and blaCTX- M-3 and blaCTX-M-55, each in an isolate. 29 E. coli were identified from group B2, 17 from group A, 10 from group D and five from group B1. Among the 26 virulence genes investigated, 17 were detected in different combinations and distributed in E. coli of all the phylogroups. A wide genetic diversity was observed, and the percentage of similarity between the lineages ranged from 51.1% to 100%. MLST typing was performed in 58 of the isolates included in this study. Of these, 27 (46.5%) were identified as ST / CC 131/131, nine (15.5%) as ST / CC 90/23, six (10.3%) as ST / CC 405/405, two (3.4%) as ST / CC 10/10, ST224, ST / CC 617/10 or ST 2851, and the other isolates were identified as ST / CC 57/350, ST / CC 155/155, ST / CC 354/354, ST / CC 648/648, ST 1177, ST 1284, ST 2208 or ST 8022, with one (1.7%) representative each lineage. Conclusions. The results of the present study allow us to conclude that the presence of E. coli producing ESBL and resistant to fluoroquinolones is mainly related to the microbiota of each patient. Also, the strains found in São José do Rio Preto are the same distributed throughout the world carriers of the same genes blaCTX-M and potential causers of UTI or distributed in food or as commensals of animals, demonstrating its wide dissemination and ease of acquisition.
Palavras-chave: Doenças Urológicas
Urologic Diseases
Sistema Urinário
Urinary Tract
Colimetria
Colimetry
Área(s) do CNPq: CIENCIAS DA SAUDE
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
Sigla da instituição: FAMERP
Departamento: Faculdade 1::Departamento 1
Programa: Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde
Citação: Porto, Naiady Konno Madela. Caracterização molecular de linhagens de escherichia coli resistentes aos ß-lactâmicos isoladas de pacientes com infecção do trato urinário. 2019. 70 f. Tese (Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde) - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
Identificador do documento: 1518
URI: http://bdtd.famerp.br/handle/tede/632
Data de defesa: 12-Jul-2019
Aparece nas coleções:Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde

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