@PHDTHESIS{ 2020:994372281,
 	title = {Caracterização de genes de resistência antimicrobiana e seu contexto genético no complexo enterobacter cloacae isolados em um hospital terciário do Estado de São Paulo},
 	year = {2020},
 	doi = "1497",
 	url = "http://bdtd.famerp.br/handle/tede/660",
 	abstract = "Bactérias do complexo Enterobacter cloacae (CEc) estão frequentemente envolvidas em infecções relacionadas à assistência à saúde e se destacam pela crescente prevalência em hospitais do mundo todo, pela resistência intrínseca a vários os beta- lactâmicos e pela capacidade de aquisição de genes de resistência a diversas classes de antimicrobianos. Apesar da importância, ainda existem poucas informações sobre a diversidade de mecanismos de resistência carreada por estas bactérias. Objetivos: Os objetivos deste estudo foram identificar e caracterizar genes de resistência responsáveis pela produção de ESBL, Carbapenemases, PMQR, AME e 16S rRNA Metiltransferases em CEc multirresistentes detectados em um hospital terciário do Estado de São Paulo; e analisar o genoma completo de isolados que apresentem mecanismos de resistência já conhecidos. Métodos: Setenta e quatro CEc isolados de 2013 a 2017 foram submetidas à PCR single e multiplex para detecção de blaSHV-5, blaSHV-12, blaCTX-M-2, blaCTX-M-15, blaCTX-M-8, blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaOXA-48, blaBKC, qnrA, qnrB, qnrS, aac(6’)-Ib-cr, qepA, OqxAB; genes AME acetiltransferases (AAC), nucleotidiltransferases (ANT), fosfotransferases (APH) e 16 rRNA Metiltransferases armA, rmtA, rmtB, rmtC, rmtD, rmtE, rmtF, rmtG e rmtH. Experimento de conjugação foi utilizado para identificação do plasmídeo carreador de gene rmtG 16S rRNA Metiltransferases. A caracterização das variantes dos genes de resistência, plasmídeos e ambiente genético foi obtida por sequenciamento tipo Sanger (Applied Biosystems®) e do genoma completo (MiSeq - Illumina®) e (MinION- Nanopore®). Resultados: Em relação aos genes de resistência, 63% das cepas apresentaram blaCTX-M-15, 29% blaCTX-M-2, 1% blaCTX-M-8, 6% blaSHV-5 e 1% blaSHV-12. Os genes PMQR encontrados foram aac(6’)Ib-cr (46%) e qnrB (14%). Entre os genes AME detectados, os mais prevalentes foram ant(2")-Ia 51%, aac(6f)-Ib 45%, aac(3)-IIa 34%, aph(3f)-Ia 21% e aph(3f)-IV 6%. Em relacao aos genes 16S rRNA Metiltransferases, um isolado apresentou rmtD-2 e dois outros isolados apresentaram rmtG. O sequenciamento dos plasmideos pEc09 e pEc13 contendo o gene rmtG mostrou sua associacao com ISCR2, ƒ¢ISCR2 e IS26 localizados em um transposon Tn3 e carreados por um plasmideo IncA/C. O gene blaKPC-2 foi identificado como determinante para a producao de carbapenemases na maioria dos isolados, com excecao de CEc 61 (Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis) carreando, entre outros genes, a nova variante BKC-2, o gene blaBKC-2 foi detectado em um plasmideo IncQ1 sem a sequencia de insercao ISKpn23. E o gene mcr-9 entre duas sequencias de insercao com alta similaridade a IS903B e IS26 localizado em um plasmideo IncFIB. Conclusao: A deteccao simultanea e a disseminacao de varios genes de resistencia aos antimicrobianos em uma mesma bacteria do complexo Enterobacter cloacae, enfatiza o impacto que esses genes transmitidos por elementos geneticos moveis causam no ambiente hospitalar.",
 	publisher = {Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde},
 	note = {Faculdade 1::Departamento 1}
}