@PHDTHESIS{ 2023:2126042384,
 	title = {Caracterização molecular e fenotípica de Acinetobacter baumannii em pacientes com COVID-19},
 	year = {2023},
 	url = "http://bdtd.famerp.br/handle/tede/854",
 	abstract = "Introdução: Acinetobacter baumannii é um patógeno oportunista hospitalar de relevância significativa e um dos microrganismos mais resistentes presentes em instituições hospitalares em todo o mundo. No entanto, a caracterização de isolados causadores de infecção em pacientes com COVID-19 ainda não foi totalmente explorada. Objetivo: Nesse contexto, o propósito central deste estudo consistiu em caracterizar fenotípica e molecularmente isolados de A. baumannii que estavam causando infecção em pacientes com COVID-19. Material e Método: Foram analisadas as amostras clínicas de indivíduos com resultados positivos para COVID-19, admitidos no Hospital de Base de São José do Rio Preto, durante o período de maio a outubro de 2020. Os isolados bacterianos foram submetidos à identificação de espécies e avaliação de susceptibilidade antimicrobiana por meio do sistema automatizado de microbiologia BD PhoenixTM. Os isolados foram então submetidos à análise de PCR dos genes de resistência, tipagem molecular e teste de formação de biofilme. Adicionalmente, realizou-se o sequenciamento do genoma completo em quatro isolados representativos. Concomitantemente, procedeu-se à revisão retrospectiva dos prontuários médicos de todos os pacientes. Resultados: Um total de 91 isolados foi recuperado de 86 pacientes, sendo que 78 (85,7%) destes originaram-se de amostras de aspirado traqueal, 8 (8,79%) de urina, 4 (4,39%) de sangue e um (1%) de fluido pleural. Destaque para o fato de que a grande maioria dos pacientes (86,04%) apresentava comorbidades e 99% necessitaram de internação em Unidade de Terapia Intensiva (UTI), resultando em uma taxa de letalidade de 63,95%. Todos os isolados manifestaram o fenótipo de resistência a múltiplas drogas (MDR) e demonstraram alta frequência de resistência aos aminoglicosídeos, fluoroquinolonas e beta-lactâmicos, enquanto apresentaram susceptibilidade à polimixina B. Em todos os pacientes, foram identificadas cepas produtoras de OXA-23. A análise de Eletroforese em Campo Pulsado (PFGE) revelou a circulação de diferentes clones de A. baumannii entre os pacientes, onde 65,92% das cepas foram agrupadas em cinco clusters principais. Adicionalmente, observou-se a presença e persistência dos clones ao longo dos seis meses de investigação. A tipagem multilocus sequence typing (MLST) identificou quatro sequence types distintos (STs): ST1 (56,04%), ST15 (37,36%), ST730 (5,49%) e ST79 (1,09%). Além disso, 78 (85,71%) dos isolados foram classificados como produtores de biofilme. A análise do core genome multilocus sequence typing (cgMLST) evidenciou uma notável proximidade genética entre as três cepas do ST1 sequenciadas. A análise de sequenciamento completo do genoma (WGS) também evidenciou uma ampla gama de genes associados à resistência e virulência, incluindo múltiplos genes de bombas de efluxo que desempenham papéis importantes em ambas as características. Conclusões: Identificamos uma ampla disseminação de A. baumannii carreador do gene blaOXA-23, exibindo o fenótipo de multirresistência. As linhagens ST1, ST15 e ST730 predominaram, com isolados semelhantes ao longo do tempo. A formação de biofilme foi observada na maioria dos isolados. A população analisada apresentou um perfil majoritariamente classificado como de alto risco, associada a uma alta ocorrência de óbitos. Destaca-se, portanto, a necessidade de estratégias direcionadas para mitigar a morbidade e mortalidade decorrentes de infecções secundárias, particularmente no contexto pós-pandêmico de COVID-19, com o intuito de prevenir desafios subsequentes e assegurar a segurança dos pacientes.",
 	publisher = {Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde},
 	note = {Faculdade 1::Departamento 1}
}