@PHDTHESIS{ 2016:1477079921,
 	title = {Abordagem computacional para identificação de marcadores moleculares e de seus ligantes com potencial aplicação no tratamento do carcinoma epidermoide de cabeça e pescoço},
 	year = {2016},
 	doi = "1293",
 	url = "http://bdtd.famerp.br/handle/tede/400",
 	abstract = "Introdução: A literatura científica sobre câncer tem crescido rapidamente nos últimos anos, o que torna difícil, se não impossível, a tarefa de recuperar e analisar manualmente as informações relevantes sobre os mecanismos que governam o processo neoplásico. Além disso, o câncer é uma doença complexa e sua heterogeneidade é particularmente evidente no câncer epidermoide de cabeça e pescoço (CECP), um dos tipos mais comuns de câncer em todo o mundo. Objetivos: Os objetivos do estudo foram (a) identificar genes/proteinas relacionados a CECP a partir de dados da literatura, (b) identificar ligantes que interajam eficiente e especificamente com alvos moleculares selecionados, (c) avaliar computacionalmente o complexo proteína/ligante e (d) avaliar a ação de ligantes na expressão gênica e no comportamento de células de carcinoma. Métodos: A busca de marcadores potenciais relacionados a CECP utilizou a mineração da literatura disponível publicamente, seguindo um fluxograma que incluiu seleção de artigos científicos no PubMed por termos MeSH, associação de artigos com genes/proteínas por meio do arquivo gene2pubmed, seleção de genes em bancos de dados externos e etapas de curação manual. As proteínas identificadas como sendo relacionadas a CECP que apresentaram envolvimento em processos inflamatórios foram submetidas a experimento de docking molecular para identificação de seus ligantes entre drogas disponíveis no mercado. Finalmente, o papel da piplartina, uma substância natural extraída da pimenta Piper longum com evidências de ação anti-inflamatória e antineoplásica, foi avaliado na proliferação, na migração e na expressão gênica de células neoplásicas. Resultados: Um total de 1370 genes relacionados a CECP foi identificado pela abordagem proposta, que mostrou especificidade de 74% e sensibilidade de 87%. A diversidade dos dados permitiu obter associações potenciais ainda não exploradas, revelando, por exemplo, que a resposta ao estímulo esteróide hormonal está significativamente enriquecida com genes relacionados a CECP. Os resultados também mostraram que a piplartina reduz a viabilidade e a migração celular e modifica o padrão de expressão de um painel de genes que atuam em processos inflamatórios. Conclusão: A abordagem empregada permite a identificação de genes relacionados à CECP e revela novas associações que merecem ser estudadas. O composto piplartina selecionado para estudos in vitro interage com alvos moleculares de forma semelhante à de medicamentos anti-inflamatórios conhecidos e é capaz de diminuir a proliferação e a migração celular e de alterar a expressão de genes relacionados à CECP e a processos inflamatórios.",
 	publisher = {Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde::-6954410853678806574::500},
 	note = {Faculdade 1::Departamento 1::306626487509624506::500}
}